SARS-CoV-2: Jak poważny jest wariant B.1.1.529, teraz o nazwie Omicron

Wariant B.1.1.529 został po raz pierwszy zgłoszony do WHO z RPA 24^th Listopad 2021. Pierwsza znana potwierdzona infekcja B.1.1.529 pochodziła z próbki pobranej 9^th Listopad 2021¹. Inne źródło² wskazuje, że wariant ten został po raz pierwszy wykryty w próbkach pobranych w dniu 11^th Listopad 2021 w Botswanie i 14^th Listopad 2021 w RPA. Od tego czasu liczba przypadków COVID-19 gwałtownie wzrosła w prawie wszystkich prowincjach Republiki Południowej Afryki. Jak na 27^th W listopadzie 2021 r. nowe przypadki tego wariantu zgłoszono również w Belgii, Hongkongu, Izraelu, Wielkiej Brytanii³, Niemcy, Włochy i Czechy, które mają pochodzenie związane z podróżami.  

Dziękujemy władzom Republiki Południowej Afryki za poświęcenie czasu na komunikowanie się i udostępnianie istotnych informacji globalnej społeczności naukowej, tak aby grupa ekspertów WHO mogła spotkać się w dniu 26^th listopada 2021 r. i szybko oznacz ten wariant jako wzbudzający obawy wariant (VOC). Powagę sprawy można było wywnioskować z faktu, że B.1.1.529 został oznaczony jako monitorowany wariant (VUM) zaledwie dwa dni temu w dniu 24^th Listopad 2021 przed wyznaczeniem jako VOC w dniu 26^th Listopad 2021 bez oznaczenia jako pierwszego wariantu objętego dochodzeniem (VOI).  

Tabela: SARS-CoV-2 Warianty wzbudzające obawy (VOC) na dzień 26 listopada 2021 r. 

Pilna potrzeba oznaczenia B.1.1.529 jako wariantu budzącego obawy (VOC) była uzasadniona, ponieważ stwierdzono, że wariant ten jest jak dotąd najbardziej rozbieżnym wariantem SARS-CoV-2. W porównaniu z wirusem SARS-CoV-2 pierwotnie wykrytym w Wuhan w Chinach, ma on aż 30 zmian aminokwasowych, 3 małe delecje i 1 małą insercję w białku kolczastym. Spośród tych zmian 15 znajduje się w domenie wiążącej receptor (RBD), części wirusa, która umożliwia mu wejście do ludzkich komórek, prowadząc do infekcji. Ten wariant ma również szereg zmian i delecji w innych regionach genomowych². Mutacje są tak rozległe, że można by nazwać to nowym szczepem, a nie wariantem. Niewiarygodnie duża liczba mutacji kolców oznacza zwiększoną możliwość ucieczki przed znanymi przeciwciałami, które sprawiają, że ten wariant jest poważnym problemem⁵.  

Zmiana na nowe warianty jest powszechna w przypadku koronawirusów. Naturą rzeczy zawsze było, że koronawirusy przechodzą mutacje w swoich genomach w niezwykle szybkim tempie, z powodu braku korekty aktywności nukleazy ich polimeraz; więcej transmisji, więcej błędów replikacji, a tym samym więcej mutacji gromadzących się w genomie, co prowadzi do nowych wariantów. W najnowszej historii ludzkie koronawirusy budują mutacje, aby stworzyć nowe warianty. Było kilka wariantów odpowiedzialnych za epidemie od 1966 roku, kiedy to nagrano pierwszy odcinek⁶. Ale dlaczego tak rozległa mutacja w jednym wybuchu? Może być, ponieważ wariant B.1.1.529 wyewoluował podczas przewlekłej infekcji osoby z obniżoną odpornością, prawdopodobnie nieleczonego pacjenta z HIV/AIDS⁷.  

Bez względu na to, jaka może być przyczyna rozległych mutacji, jeśli szybkie tempo rozprzestrzeniania się tego wariantu w Afryce Południowej jest jakąkolwiek wskazówką, ewolucja tego wariantu może mieć ogromny wpływ na odporność, przenoszenie i zjadliwość oraz skuteczność istniejących obecnie stosowanych szczepionek.  

Niezależnie od tego, czy istniejące szczepionki pozostaną skuteczne przeciwko temu nowemu wariantowi, czy też pojawi się więcej przypadków przełomowych infekcji szczepionkowych, obecnie dostępnych jest niewiele danych, aby wyciągnąć jakiekolwiek wnioski. Jednak w niedawnym badaniu syntetyczny wariant z 20 mutacjami w białku wypustek wykazał prawie całkowitą ucieczkę przed przeciwciałami⁷. Wskazuje to, że nowy wariant B.1.1.529 o znacznie większej liczbie mutacji może wykazywać znacznie zmniejszoną neutralizację przez przeciwciała. Wydaje się jednak, że nowy wariant jest bardziej przepuszczalny, biorąc pod uwagę szybkie tempo, w jakim zastąpił wariant Delta w RPA, chociaż obecne dane nie są wystarczająco adekwatne, aby dokonać jakichkolwiek wiarygodnych szacunków. Podobnie na tym etapie nie można komentować nasilenia objawów.  

Biorąc pod uwagę fakt, że Europa już teraz boryka się z niezwykle dużą liczbą przypadków COVID 19 (ze względu na wysoce zakaźny wariant delta) w ciągu ostatnich kilku tygodni i szybkim tempem, w jakim Omicron (B.1.1.529) Wariant rozprzestrzenił się w RPA ostatnio zastępując wariant delta, kilka krajów w Europie, w tym Wielka Brytania, Niemcy i Włochy, nałożyło ograniczenia podróżowania na przyjazdy z RPA i z sąsiednich krajów, takich jak Botswana, Malawi, Mozambik, Zambia i Angola. Obawiając się najgorszego, Izrael ma zakazać wjazdu gościom ze wszystkich krajów.  

Świat zainwestował tak wiele w opracowywanie i podawanie szczepionek COVID-19, aby chronić ludzi przed pandemią. Zarówno naukowcy, jak i autorytety zadają sobie pytanie, czy główne szczepionki na COVID-19, takie jak Pfizer-BioNTech, Oxford-AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson, pozostaną również skuteczne przeciwko wariantowi Omicron (B.1.1.529) . Jest to podsycane przez fakt, że w Republice Południowej Afryki odnotowano przełomowe infekcje. Dwa przypadki z Hongkongu również otrzymały dawki szczepionki⁹. 

Rozwój szczepionek „pan-koronawirusowych”¹⁰ (platformy ze szczepionkami multiwalentnymi¹¹) wydaje się być potrzebą godziny. Ale szybciej może być możliwe wyprodukowanie dawek przypominających szczepionek mRNA i DNA obejmujących mutacje. Ponadto niedawno zatwierdzony leki przeciwwirusowe (Molnupiravir firmy Merck i Paxlovid firmy Pfizer) powinny przydać się w ochronie ludzi przed hospitalizacją i śmiercią.   

 *** 

Referencje:  

1. WHO 2021. Wiadomości – Klasyfikacja Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Wariant problemu. Opublikowano 26 listopada 2021. Dostępne online pod adresem https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Europejskie Centrum Zapobiegania i Kontroli Chorób. Konsekwencje pojawienia się i rozprzestrzeniania SARSCoV-2 B.1.1. 529 wariant budzący obawy (Omicron), dla UE/EOG. 26 listopada 2021 r. ECDC: Sztokholm; 2021. Dostępne online pod adresem https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Rząd Wielkiej Brytanii 2021. Komunikat prasowy – Zidentyfikowano pierwsze przypadki wariantu Omicron w Wielkiej Brytanii. Opublikowano 27 listopada 2021 r. Dostępne pod adresem https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WHO, 2021. Śledzenie wariantów SARS-CoV-2. Dostępne online pod adresem https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: potomek B.1.1 związany z Afryką Południową z dużą liczbą mutacji Spike #343. Dostępne online pod adresem https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Warianty koronawirusa: co wiemy do tej pory. Naukowy europejski. Opublikowano 12 lipca 2021. Dostępne online pod adresem http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Prace nad szczepionkami – Co wiemy o nowym wariancie koronawirusa B.1.1.529 i czy powinniśmy się martwić? Dostępne o https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt F., Weisblum Y., Rutkowska M. i in. Wysoka bariera genetyczna uniemożliwiająca ucieczkę poliklonalnych przeciwciał neutralizujących SARS-CoV-2. Natura (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Silnie zmutowany wariant koronawirusa wprawia naukowców w stan pogotowia. Natura New. Zaktualizowano 27 listopada 2021 r. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. Szczepionki „pan-koronawirusowe”: polimeraza RNA pojawia się jako cel szczepionki. Naukowy europejski. Opublikowano 16 listopada 2021. Dostępne na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Komunikat prasowy – NIAID wydaje nowe nagrody na finansowanie szczepionek „pan-koronawirusowych”. Opublikowano 28 września 2021. Dostępne na https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***